在遠離大都會的鄉下，有一個名叫“企鵝村”的小村莊，這裡住著一個名叫則卷千兵衛的天才博士。他發明了各種各樣奇怪的道具，而女孩子機器人阿拉蕾正是他的諸多作品之一。阿拉蕾力大無比，聰明非常，不過卻只有幼兒園

在大冒險01三年後，本宮大輔、井上京、火田伊織、一乘寺賢四個小朋友、與及01中拯救數碼世界的八位小朋友一起進入數碼世界進行冒險。