一夥神秘匪徒意欲在即將舉行的祭天盛典上行刺皇帝，六扇門必須在此之前將該案破獲。種種線索指向襄陽的蒼生客棧，當玄武小組趕到時，一夥匪徒竟將整個客棧的客人劫為人質——而他們的目標，卻在所有人的預想之外

大金使節達哈蘇出使大明以求兩國平和，六扇門接到使命護衛。卻不料達哈蘇抵達後，其副手俄然發問，裡應外合佔據了六扇門，目的是要殺死達哈蘇，挑起兩國戰役。面臨淪亡，同門慘遭屠殺，玄武小組打開拼死的激戰。

　　京城出現天啟通寶的假幣，皇帝大怒，命六扇門徹查此事，玄武小組成員奉命調查此事，順藤摸瓜發現巨賈柳百川與假幣案有千絲萬縷的聯繫，隨著調查的深入，他們發現了柳百川的另一個身份，也由此離真相更近了一步。

張一奉命執行一項任務，不想卻中了圈套。周衝帶著祝英前去營救，裡應外合救出張一，並從倭寇手中救出數名村民，將倭寇頭子竹下一郎正法，投敵叛國的將軍劉猛受到懲罰。周沖和張一祝英正式組成“玄武”小組。

一宗多年前的殺人案浮出水面，牽出一個在逃的殺手，六扇門捕快張一和劉魁聯手偵查，發現案中有種種蹊蹺，就在案情逐漸大白時，劉魁和張一的身份也浮出水面，劉魁為了張一犧牲了自己，而張一則決定和過去訣別。

　　本劇取材於《聊齋志異》中的六個故事。《封三娘》：靈狐封三娘為百姓打抱不平進入孟家，卻發現孟家的壞名聲只是遭人陷害，於是幫助孟家脫險，收穫了自己的愛情。《阿繡》：狐女花月冒充人間女子阿繡，與劉子固糾

　　神秘殺手殺死琴館盲女，引出了逃亡在外的唐珂。追查中張一發現，仍有十枚毒火球流落江湖，並被一個女殺手計劃用來除掉朝中反對魏忠賢的一干忠臣！危急時刻，玄武小組再次出戰，而唐珂也由此將了結唐門的血海深仇

高麗叛軍突起，大明援其火器並由高麗將軍崔代元押送，不料途中被劫，六扇門玄武小組調查發現是監守自盜蓋因崔之義女被叛軍綁架，陷崔於兩難境地。玄武小組為崔打動，誓在追回火器的同時救出人質，保其忠義兩全！

多年前一次失誤，捕頭周衝多名部下喪命玄鐵鏢，周衝也一蹶不振。最近內閣大臣蔣進之女遭綁架，案發現場竟發現了玄鐵鏢蹤跡，周衝請命重回六扇門，順藤摸瓜打入敵穴，救出蔣進之女，並一步步接近當年陰謀的真相……

一宗多年前的殺人案浮出水面，牽出一個在逃的殺手，六扇門捕快張一和劉魁聯手偵查，發現案中有種種蹊蹺，就在案情逐漸大白時，劉魁和張一的身份也浮出水面，劉魁為了張一犧牲了自己，而張一則決定和過去訣別。