《代號深海》的故事發生在民國上海灘，梁軍是混跡於大上海三教九流遊走于軍統和黑市之間的特殊角色，在愛民醫院的一次醫鬧事件中梁軍遇到了失蹤多年兒時青梅竹馬的王玉梅，後來梁軍經過王玉梅的感召，在組織的層層考