延續前一集的劇情，獅子亞歷克斯（本·斯蒂勒 Ben Stiller 配音）、斑馬馬蒂（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）、長頸鹿邁爾曼（大衛·休默 David Schwimmer 配音）、河馬

在紐約的中央公園裡，生活著這樣一群無憂無慮的好朋友：獅子亞利克斯、斑馬馬蒂、長頸鹿麥爾曼以及胖河馬格洛麗亞。他們的性格開朗活潑，因此每天的生活都過得豐富多彩。直到有一天，一群流浪的企鵝令斑馬馬蒂產生了

延續前一集的劇情，獅子亞歷克斯、斑馬馬蒂、長頸鹿邁爾曼、河馬格洛里亞以及企鵝們，為了能離開馬達加斯加島回到五光十色的紐約，對一架破舊的失事飛機進行維修改造，併成功起飛。當大家已經開始慶祝終於可以回到紐