在上一年的全國大賽中取勝的主人公·小野田坂道所屬的總北高中。組建隊伍的前輩們紛紛畢業、引退，作為新世代的隊伍開始進發的他們，在互相刺激、支持、提升的過程中，順利打入以連霸為目標的全國大賽。之後，決戰之

全人類因謎般的現象而在一瞬間石化，之後過了數千年——。　　擁有超越人類的頭腦，天生的科學少年·千空甦醒了。　　“從石器時代到現代文明，要跨越這科學史上的200萬年！”。　　在這走投無路的狀況中，